Kapal yang dikelola PT. ASDP Indonesia Ferry Cabang Merak ada delapan yang terdiri atas, KMP Jatra 2, KMP Jatra 3, KMP Sebuku, KMP Batumandi, KMP Legundi, KMP Portlink, KMP Portlink 3, dan KMP Portlink 5.
Sementara, ada 21 perusahaan swasta yang juga mengoperasikan kapal di Pelabuhan Merak sebagai berikut :
1. PT Windu Karsa
- KMP. Windu Karsa Pratama
- KMP. Adinda Windu Karsa
2. PT Dharma Lautan Utama
Baca Juga:Polda Banten Terapkan 'Delay System' Pada Arus Mudik Lebaran 2025 di Pelabuhan Merak
- KMP. Musthika Kencana
- KMP. Kirana II
- KMP. Dharma Kencana IX
- KMP. Dharma Rucitra 1
3. PT. Trisakti Lautan Mas
- KMP. Trimas Kanaya
- KMP. Trimas Laila
- KMP. Trimas Fhadila
4. PT Jemla Ferry
- KMP. Mufidah
- KMP. Menggala
- KMP. Rajarakata
- KMP. Virgo 18
- KMP. Duta Banten
- KMP. Jagantara
- KMP. Athaya
5. PT Prima Visita
- KMP. Mabuhay Nusantara
6. PT Garis Munic
- KMP. Elysia
- KMP. Munic 9
- KMP. Munic 1
- KMP. Caitlyn
- KMP. Neomi
- KMP. Caitlyn 7
7. PT Jalur Bukit Merapin Nusantara
Baca Juga:Tarif Penyeberangan Merak-Bakauheni 8 Maret 2025, Cek Update Tarif Terbaru!
- KMP. Seira
- KMP. Suki 2
8. PT Jalur Surya Timur
- KMP. Zoey
- KMP. Rishel
- KMP. Shalem
- KMP. Amarisa
9. PT Gunung Makmun Permai
- KMP. Rajabasa 1
10. PT Hasta Mitra Baruna
- KMP. HM Baruna 1
11. PT Raputra Jaya
- KMP. Raputra Jaya 888
- KMP. Raputra Jaya 2888
12. PT Garis Tri Sumaja
- KMP. BSP 1
- KMP. Salvatore
13. PT Atosim Lampung Pelayaran
